На территории Прииссыкулья насчитывается около 1500 исторических памятников, из которых 320 находится под защитой государства. К наиболее значимым из них относятся сакский "Царский курган" (VII в до н. э. - II в н. э.) у села Курменты, могильники Кок-Булак и Карашар (в общей сложности около тысячи захоронений усуньских племен), исписанный тибетскими письменами религиозного характера камень Тамга-Таш (VI-I вв. до н. э.), скопление петроглифов (II тысячелетие до н. э. - VIII в. н. э.) у Чолпон-Ата и далее по побережью до Тамчы, а также мыс Святой Нос на северо-восточной оконечности озера - место расположения легендарного монастыря Армянской христианской церкви (IV-V вв.) в котором, по преданиям, находится могила святого апостола Матфея. На сегодня археологам Кыргызстана известно около двух десятков затопленных древних городов находящихся под водою. В них обнаружено множество исторических и культурных ценностей сакско-усуньского периода (1 тысячелетие до н.э.) - керамика, глиняные кувшины и бронзовые котлы, различные металлические изделия - и раннего средневековья - хумы, котлы, посуда монголо-тимуридского времени, голубая керамика, монеты. Любители подводного плавания и археологии со всего мира приглашаются на Иссык-Куль; здесь они смогут увлекательно провести время и отдохнуть.